日本免稅新制將於11月1日正式上路，退稅流程出現重大變革。旅客在免稅店購物時，須出示護照並先支付包含消費稅的價格，同一商店同日未稅消費須達5,000日圓以上才符合免稅門檻。店家會登錄購物資料，要求旅客完成退款資訊登記，包括信用卡、銀行帳戶或指定退稅平台。部分百貨公司仍要求旅客於購物當日至退稅櫃台辦理。
新制規定旅客須在購買日起90天內攜帶免稅商品出境，離境時在托運行李前完成海關確認程序。目前提供兩種確認方式，一是使用機場免稅自助機KIOSK掃描護照，二是透過Visit Japan Web系統辦理，但僅限成田、羽田、關西、中部、新千歲、福岡、那霸七座機場適用。系統判定結果若顯示綠色代表無須檢查商品，紅色則須前往海關指定區域出示免稅商品。
海關確認完成後，相關資訊會傳送給免稅店或退稅平台處理退款。退款方式包含信用卡、銀行轉帳、電子支付及機場現金退款，實際入帳時間與手續費依各業者規定而定。支援新制的退稅服務商包括J-TaxRefund、PIE VAT、JPrefund與Global Blue等，不同平台在操作方式、手續費及退款管道上各有差異。
新制取消食品、化妝品等消耗品的特殊密封包裝規定,但這些商品仍不得在日本境內消耗。海關以單筆購物紀錄作為確認單位，若同一張收據中有任何商品已使用或未攜帶,可能導致整筆交易無法退稅。唐吉訶德、Bic Camera、多慶屋與鶴羽藥妝宣布免收退稅申請手續費,但選擇機場領取現金仍須支付現金退款服務業者的手續費。
